一个被忽视的行业，一群门外汉，一个 35 页提示词，一万小时 H100，一张实验室账单，211 个蛋白设计，17 个阳性结果。
故事从投资问题开始，落在了试管里的新蛋白上。
" 网红研究所 "Citrini Research 最初想搞清楚的是一个投资问题：AI 制药到底走到哪一步了？
过去几年，生命科学和医疗板块经历了明显降温。疫情红利退潮，融资环境收紧，二级市场估值回落，一级市场出手谨慎。相比之下，AI 基础设施、半导体、算力链成了更热的叙事。生物医药这个曾经被资本追逐的赛道，开始显得有些冷清。
但 Citrini 看到的机会也在这里：如果一个被市场冷落的行业，真的被 AI 工具改造，那么增长预期可能被低估。
问题在于，没人能给他们一个统一答案。问科学家，有人说 AI 还没做出过真正重要的新药；也有人认为 AI 会在几年内重塑药物研发体系。对一家投资研究机构来说，这种分裂判断很难变成投资结论。
于是，他们决定亲自下场。
团队只有 5 个人，其中 3 个几乎没有生命科学背景，另外 2 个有一点相关经验，也谈不上药物研发老兵。预算 20 万美元，时间 3 个月。他们给自己定了一个听上去很冒险的目标：借助 Claude，设计一种真实可合成、可测试的新蛋白。
如果实验室结果能证明它有效结合目标，哪怕只跨出第一步，也足以说明一件事：AI for Science 的门槛正在下降，门外汉也开始有机会进入过去高度专业化的科学发现流程。
一个投资团队，为什么盯上蝎毒？
Citrini 一开始没有直接选择蝎毒。他们先列出几个筛选条件：实验验证要快，成本要可控；问题本身要依赖分子设计能力；最好还有现实公共健康价值，同时长期缺少投入。
候选方向包括罕见儿童疾病、艰难梭菌感染、阻断强效芬太尼类似物的 " 疫苗 "、降低莱姆病风险的抗蜱方案。最后留下来的方向，是抗毒血清。
蛇毒方向此前已有 AI 蛋白设计案例。Citrini 想找一个更新、更少被关注的目标，于是把视线转向蝎毒。
现有抗蝎毒血清生产方式相当传统：采集蝎毒，向马体内注入受控剂量，等待马产生抗体，再从血浆中提取和纯化。流程耗时、昂贵，还依赖动物。
Citrini 想试一条新路：直接设计一种小蛋白，让它像 " 分子夹子 " 一样抓住蝎毒中的神经毒素。这类小蛋白被称为 minibinder，体积比抗体更小，理论上可通过合成生物学方式生产。对一个预算有限、时间有限的团队来说，蛋白设计更贴近当前 AI 能力边界。
他们最终选定 5 种蝎毒神经毒素，覆盖墨西哥、巴西、北非和中东等地区代表性毒素。最初目标很朴素：先设计出能结合单一毒素的蛋白。只要体外实验能证明 " 抓得住 "，就已经是重要信号。
随后，团队又加了一道更难的题：能否设计一个单一分子，同时结合 5 种毒素？
Claude 提醒他们，成功概率很低。5 种毒素虽然同属蝎毒神经毒素，但表面结构、关键位点、电荷分布和空间构象都有差异。想用一个小蛋白同时匹配多个靶标，相当于让一把钥匙打开五把结构不同的锁。
团队还是决定试一试。
这一步很有象征意义。AI 可以让门外汉进入蛋白设计流程，但生命科学的难度不会因为提示词变长就自动消失。
35 页提示词，300 多个 Agent，1 万小时 H100
真正开始前，Citrini 和 Anthropic 团队花了大量时间设计提示词。最终形成的提示词长达约 35 页，里面写清楚了目标毒素、设计约束、评估工具、筛选规则、候选分配和实验室所需信息。
这已经不像普通聊天，更像一份交给 " 虚拟干实验团队 " 的研究计划书。
随后，Claude 开始接管大部分计算设计流程：查文献、调工具、做结构预测、管理计算资源、筛选候选方案。它还在人类监督下给 Twist Bioscience 的科学家写邮件，询问某些融合蛋白和双特异性构型能否制造。收到回复后，Claude 再把供应商的制造约束写回设计流程，继续推进。
这一点很关键。真实科研从来不只存在于论文和模型里，还要经过供应商、制造限制、实验排期、样品制备等现实环节。Claude 能把这些信息串起来，项目才有了完整工作流的样子。
根据 Citrini 披露，整个设计活动用了略多于 10000 小时 H100 GPU。算力费用 49997 美元，Claude 甚至比预算少花了 3 美元。后续 DNA 合成、蛋白表达纯化、结合测试和可开发性评估等实验费用接近 15 万美元。20 万美元预算基本花满。
在 64 小时设计阶段里，Claude 生成超过 31 万个蛋白设计，筛出 180 个。经过后续四轮跟进，人类与 Claude 又补充了一批候选，最终 211 个方案被送往实验室合成和测试。
这正是 AI for Science 变化最直观的地方。专业能力开始被拆解成工具链：大模型负责理解目标、调度流程、整合文献、生成设计；外包实验室负责验证；人类负责设定问题、监督风险、判断方向。
211 个蛋白送进实验室，17 个阳性结果，覆盖 5 种毒素中的 4 种
计算机里的结构图再漂亮，也不能算科学结果。C
itrini 把候选方案送到 Adaptyv Bio 和 Twist Bioscience，进行 DNA 合成、蛋白表达纯化和结合测试。实验结果显示：
211 个送测设计中，17 个达到预设结合标准，覆盖 5 种毒素中的 4 种。
团队还做了竞争结合实验。已知有一种抗体片段 LR 可以中和 Cn2 毒素。实验显示，当 LR 先占住毒素后，Claude 设计蛋白与毒素的结合受到明显影响。这提示 Cn2-B1、Cn2-B2 可能抓住了与 LR 相同或相邻的位置。
这很重要。抗蝎毒蛋白真正要做的事情，不能只是在任意位置贴住毒素，最好能挡住毒素与神经细胞钠通道作用的关键区域。竞争实验至少给出了一条积极线索：Claude 设计出的蛋白，可能抓到了有功能意义的位置。
同时，最难的 " 通吃五种毒素 " 目标失败了。没有任何设计被证明可以同时结合多种毒素。Claude 最初的风险提示应验。
这个结果反而让案例更可信。AI 没有魔法般跨过所有生物物理限制。它在单一靶标上交出实验阳性候选，在多靶标通用分子上撞到墙。成功和失败都清楚地落在实验数据里。
还没变成药，但已经越过一道门槛
目前这些蛋白只证明了 " 能结合毒素 "。它们还没有证明能中和毒素，也没有证明能保护细胞、动物或人体。
下一步需要功能实验。比如先确认毒素确实会扰乱细胞离子通道，再用 patch-clamp 等方法测试这些蛋白能否阻止或逆转毒素作用。之后才可能进入动物保护实验，评估剂量、起效速度、体内停留时间、安全性、免疫反应和制造稳定性。
换句话说，距离真正可用的抗蝎毒治疗方案仍有很长距离。
但这次实验的价值已经出现：一群几乎没有药物研发背景的人，在 AI 工具、实验外包和专家安全框架帮助下，可以从一个投资问题出发，走到 " 部分实验验证的新蛋白 " 这一步。
Citrini 没有变成传统意义上的生物技术公司。它依然是一家投资研究机构。但它用 20 万美元和 3 个月时间摸到了一条新边界：科学发现的入口正在被重新打开。
AI 制药进入下一阶段
把 Citrini 的故事放在 AI 制药行业的大背景里看。过去几年，AI 制药经历过一轮高预期。市场曾期待 AI 直接缩短新药研发周期、显著降低成本、快速推出重磅药物。现实更复杂。药物研发的瓶颈很多：靶点选择、分子设计、成药性、毒性、临床入组、制造放大、监管审批，每一关都可能让项目停下来。
因此，AI 制药接下来的进展，大概率不会体现为某个模型 " 一步生成新药 "，更可能体现在研发链条的多个环节被持续压缩。
Anthropic 展示的是大模型协调蛋白设计流程的能力；Radical Numerics 把 AI 设计噬菌体推进到耐药菌感染患者的同情用药场景；OpenAI 通过 Rosalind 和 Orchestra Bio，把 AI 延伸到科研项目管理、实验依赖追踪和研发流程协调。
这三类能力拼在一起，正好对应 AI 制药的三个关键方向：设计分子、验证生物功能、管理复杂研发系统。
Citrini 案例给行业的启发尤其直接：AI 制药未来的参与者可能会更多元。药企、CRO、顶级实验室依然重要，但越来越多带着具体问题、具体资源、具体判断的人，也可以进入科学工作流。他们未必会独立完成全流程，却能提出被忽视的需求，组织工具和实验资源，快速形成可验证结果。
这会改变早期研发的供给方式。过去，一个冷门疾病或边缘公共卫生问题，很难吸引大药企投入。现在，如果 AI 能够降低早期探索成本，小团队就有机会先跑出实验信号，再吸引基金会、政府、药企或产业资本接力。
