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北大课题组最新研究提示:新型冠状病毒中间宿主或为水貂

新京报 01-25

蝙蝠和水貂可能是新型冠状病毒的两个潜在宿主,其中水貂可能为中间宿主。

文 1411 字,阅读约需 3 分钟

新型冠状病毒的传染源至今未明。北京大学工学院生物医学工程系教授朱怀球团队 1 月 24 日发表的研究文章提示,蝙蝠和水貂可能是新型冠状病毒的两个潜在宿主,其中水貂可能为中间宿主。

上述研究文章题为 " 深度学习算法预测新型冠状病毒的宿主和感染性 ",发表于 bioRxiv 预印版平台,研究使用的是基于深度学习算法开发的 VHP(病毒宿主预测)方法,用以预测新型冠状病毒潜在宿主。

研究提示,与感染其他脊椎动物的冠状病毒相比,蝙蝠 SARS 样冠状病毒与新型冠状病毒具有更相似的感染模式。此外,通过比较所有宿主在脊椎动物上的病毒传染模式,发现水貂病毒的传染性模式更接近新型冠状病毒。

这说明,蝙蝠和水貂可能是新型冠状病毒的两个潜在宿主。

记者注意到,1 月 23 日,中国科学院武汉病毒研究所研究员石正丽团队在 bioRxiv 预印版平台上发表文章 " 一种新型冠状病毒的发现及其可能的蝙蝠起源 "。该研究表明,新型冠状病毒的自然宿主最有可能是蝙蝠,它与云南菊头蝠中存在的 RaTG13 冠状病毒一致性高达 96%。

病毒感染力方面,朱怀球团队研究表明,新型冠状病毒的 6 个基因组都极有可能感染人类。预测结果提示,新型冠状病毒具有与严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)、蝙蝠 SARS 样冠状病毒(Bat SARS-like CoV)和中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)类似的感染人类的强大潜力。

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【对话】

课题组成员、浙江大学医学院第一医院、传染病诊治国家重点实验室副主任肖永红

" 新型冠状病毒与 SARS 病毒相似度很高 "

新京报:研究有哪些主要发现?

肖永红:新型冠状病毒肺炎暴发以来,病毒的传染源一直没有找到。我们利用深度学习算法,分析了现有数据,包括新型冠状病毒及其他冠状病毒的基因序列,以及 GenBank(基因数据库)中所有可用的脊椎动物病毒数据等。

研究发现,新型冠状病毒与其他冠状病毒有相似的传染过程。蝙蝠身上有多种冠状病毒,这些冠状病毒可能先传染至哺乳动物,再传染到人。比如 MERS 病毒,中间宿主就是骆驼。

对于新型冠状病毒来说,研究预测,蝙蝠是它的最主要来源,中间宿主可能是水貂。

新京报:研究主要基于日前公布的新型冠状病毒全基因序列吗?

肖永红:是的。对科学研究来说,病毒全基因序列非常重要。新型冠状病毒和相似病毒的进化分析,新型冠状病毒的检测方法,都基于全基因序列。另外,病毒发病机制研究、新型冠状病毒治疗药物及疫苗的研发,也基于全基因序列。

新京报:从全基因序列看,新型冠状病毒与 SARS 病毒有什么关联?

肖永红:我认为它和 SARS 病毒的类似度很高。首先,新型冠状病毒与 SARS 病毒同属于冠状病毒的 β 属,而且两种病毒的基因组序列 80% 相同,同源性很高。其次,从现有研究看,两种病毒入侵人体细胞的主要受体都是 ACE2。第三,新型冠状病毒感染的肺炎发病时间也和 SARS 相似。

两者不是完全相同的病毒,但关联性很高。

新京报:昨天中国疾控中心首次公布成功分离的我国第一株病毒毒种信息及其电镜照片,这意味着什么?

肖永红:全基因序列是拿到了病毒的信息,中国疾控中心在实验室中把病毒培养出来了,这对于研究病毒致病机制、药物研发都非常有帮助,奠定了非常好的基础。通俗地说,全基因组序列找到了 " 贼 " 的证据,现在是把 " 贼 " 抓住了。

新京报记者 许雯 编辑 陈思

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